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dongQ:master
src-openEuler:master
dongQ
创建于 2024-09-02 14:02
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改进： RNA-seq 比对 (Miniprot 剪接模型)： 默认模型更改：Miniprot 剪接模型现在是 RNA-seq 比对的默认模型。 优势：该模型改进了 RNA-seq 的准确性和敏感性，尤其是在人类真实数据上。它考虑了非 GT-AG 剪接位点，准确性和敏感性略有提高 (<0.1%)。 变更： 默认 -I 参数增至 8G： 影响：minimap2 会为一对哺乳动物基因组创建单一部分索引。对于大数据集，所有对所有的读段重叠比对可能会增加内存使用。 新功能： 输出次级比对序列： 实现方式：通过使用选项 --secondary-seq（#687）。 错误修复： 修复 --rmq 参数解析问题（#1010）。 修复在对目标序列应用终端加分时可能出现的坐标错误问题（#1025）。这是一个 ksw2 的错误，但不影响 minimap2，因为 minimap2 没有使用受影响的功能。 改进： 兼容性增强： 平台支持：包括增强与 Windows 的兼容性（#1051）以及与 Oxford Nanopore Technologies 的集成改进（#1048 和 #1033）。
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git checkout master
git pull https://gitee.com/dongqi1111/minimap2.git master
git push origin master
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jingxiaolu
jingxiaolu
yanan-rock
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myeuler
myeuler
ethan848
ethan848
fcwicky
fcwicky
love_hangzhou
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forrest_ly
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caodongxia
caodongxia
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wang--ge
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jingxiaolu
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严重
主要
次要
不重要
标签
openeuler-cla/yes
ci_successful
sig/dev-utils
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里程碑
未关联里程碑
参与者
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git@gitee.com:src-openeuler/minimap2.git
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