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dongQ:master
src-openEuler:master
dongQ
创建于 2024-09-02 14:02
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改进: RNA-seq 比对 (Miniprot 剪接模型): 默认模型更改:Miniprot 剪接模型现在是 RNA-seq 比对的默认模型。 优势:该模型改进了 RNA-seq 的准确性和敏感性,尤其是在人类真实数据上。它考虑了非 GT-AG 剪接位点,准确性和敏感性略有提高 (<0.1%)。 变更: 默认 -I 参数增至 8G: 影响:minimap2 会为一对哺乳动物基因组创建单一部分索引。对于大数据集,所有对所有的读段重叠比对可能会增加内存使用。 新功能: 输出次级比对序列: 实现方式:通过使用选项 --secondary-seq(#687)。 错误修复: 修复 --rmq 参数解析问题(#1010)。 修复在对目标序列应用终端加分时可能出现的坐标错误问题(#1025)。这是一个 ksw2 的错误,但不影响 minimap2,因为 minimap2 没有使用受影响的功能。 改进: 兼容性增强: 平台支持:包括增强与 Windows 的兼容性(#1051)以及与 Oxford Nanopore Technologies 的集成改进(#1048 和 #1033)。
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git pull https://gitee.com/dongqi1111/minimap2.git master
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hexiaowen
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jingxiaolu
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ethan848
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fcwicky
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love_hangzhou
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forrest_ly
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caodongxia
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次要
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标签
openeuler-cla/yes
ci_successful
sig/dev-utils
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未关联
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未关联里程碑
参与者
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git@gitee.com:src-openeuler/minimap2.git
src-openeuler
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